‘’Men heeft dikwijls gezegd dat het ‘’de lichte troepen’’ der Katholiciteit waren, die daar parochiëerden; ik heb het nooit waar bevonden. Ik heb altijd gezien dat die Italiaanse en Franse manufacturiers, Italiaanse prentenkopers en schoorsteenvegers, Italiaanse, Franse en Brabantse kooplieden en bankiers, Franse boekverkopers en horlogemakers, Franse kappers en modemakers heel goed en stichtelijk baden.’’

De auteur van dit citaat, Joseph Alberdingk Thijm, is een van de meest bevlogen katholieke schrijvers van Amsterdam in de negentiende eeuw. In deze verdediging van de vroomheid van zijn medeparochianen van de Franse Kerk beschrijft hij tegelijkertijd de grote diversiteit onder de kerkgangers. Wie echter vandaag de dag op zoek gaat naar deze kerk aan de Nieuwezijds Voorburgwal, treft daar niets meer aan dat herinnert aan een katholieke schuilkerk. Slechts enkele verspreide objecten dragen de geschiedenis van de kerk met zich mee. In de collectie van Museum Ons’ Lieve Heer op Solder bevinden zich twee levensgrote beelden van de heiligen Petrus en Paulus, die oorspronkelijk aan weerszijden van het hoogaltaar hebben gestaan. Zij onthullen de officiële naam van de Franse Kerk: HH. Petrus en Pauluskerk.

Rond het begin van de twintigste eeuw verlaten veel Amsterdammers de oude binnenstad en laten zij vereenzaamde kerken achter. De bijkerk van de Franse Kerk, De Papegaai in de Kalverstraat, is al een halve eeuw eerder omgebouwd tot een neogotische kerk. Daarom wordt ervoor gekozen De Papegaai te behouden en de Franse Kerk te sluiten.

De sluiting van een kerk is in 1911 een ongebruikelijke gebeurtenis. De hoogste kerkelijke instanties in Rome worden bij de sluitingsprocedure betrokken. Op 30 mei 1911 komen hun bepalingen binnen: ‘’Als voorwaarde zal dan slechts worden gesteld dat het gebouw niet zal worden gebruikt voor minder honeste doeleinden en dat er, ter herinnering aan de vroegere bestemming, in den gevel een kruis zal worden aangebracht.’’ De kerkbestuurders nemen de voorwaarde dat het gebouw niet voor ‘’minder honeste doeleinden’’ zal worden gebruikt uiterst serieus. Voor de zekerheid wordt daarom de Franse Kerk in 1912 volledig afgebroken.